保护区内有国家Ⅰ、Ⅱ级保护动物27种,我国特有种17种,占我国特有种的 24.6％.列入CITES名录的有20种.对保护区鸟类的垂直区系分析发现,随海拔高度的增加,东洋界成分所占比例增加,主要是喜马拉雅-横断山区型的比例增加,在海拔3 000 m以上。2002年4月～2003年6月对四川九寨沟自然保护区的鸟类进行调查,并结合历史文献,确认保护区有鸟类222种,以留鸟和夏候鸟为主,占保护区鸟类总数的86.48％.对保护区繁殖鸟类的区系分析表明:古北界种类占繁殖鸟总数的33.85％,东洋界种类占55.21％,广布种占10.94％,可见东洋界种类占优势.保护区内有国家Ⅰ、Ⅱ级保护动物27种,我国特有种17种,占我国特有种的 24.6％.列入CITES名录的有20种.对保护区鸟类的垂直区系分析发现,随海拔高度的增加,东洋界成分所占比例增加,主要是喜马拉雅-横断山区型的比例增加,在海拔3 000 m以上。
